حوزههای علمیه در ایران به عنوان یکی از نهادهای مهم مذهبی و سیاسی تاثیرگذار در تحولات تاریخ معاصر ایران، نقش بسزایی داشتهاند. در این میان یکی از مهمترین مراکز حوزه علمیه در ایران از قدیمیترین دوران شهر مقدس مشهد بوده است. این شهر به خاطر مدفن امام هشتم شیعیان و توجه و اقبال همگانی مردم از آغاز، یکی از پایگاههای روحانیت شیعه در رابطه با فعالیتهای سیاسی نهضت امام خمینی بوده است.